在处理建筑工程转包的开票问题时，应遵循以下步骤和原则：

发票类型

应开具增值税专用发票。

发票代码需清晰，内容应包含转包合同详情和转包金额。

发票开具方

若转包后以B公司名义经营，则由B公司给A公司开具发票。

若转包后以C公司名义经营，则由C公司给A公司开具发票。

发票内容

详细列明承包方为主体的服务或商品内容。

包含合同约定的服务或商品交付项目。

税务处理

结算时应到工程所在地的税务机关开具发票并即时完税。

总承包人向兴建单位收取款项时，需凭分包（转包）人开出的发票作为已完税依据进行抵减，余额部分需征税。

发票存根联

税务机关在开出全额发票时，应在发票存根联上注明分包工程的开票金额和字轨号码。

发票内容与实际服务匹配

确保发票内容与实际提供的服务或商品相匹配。

发票内容与合同条款一致

确保发票内容与转包合同或工程商品买卖转包合同的约定一致。

请根据具体情况，遵循当地税务机关的规定和流程进行操作。